Gérard Nafilyan est maître de conférences honoraire à l'Université Paris I (Panthéon-Sorbonne), et professeur au Collège des Hautes études européennes Miguel Servet. Il a été administrateur du Centre d'Information Sources d'Europe, directeur du Centre universitaire d'Etudes des Communautés européennes (CUECE), conseiller juridique auprès de la représentation en France de la Commission européenne et professeur au Collège d'Europe à Natolin (Varsovie).